SSDドライブ増設等でCドライブを入れ替えた場合、User,TEMPなどの頻繁に書き換えが起きるシステムフォルダは既存のHDDに…という方は多いと思います。私もそうしました。
ただし、仮に D:\Users へとなると、レジストリを編集したり、INIファイルを編集したりを、大変な作業を強いられます。
そこで、ほとんどの方は、fsutil hardlink create でハードリンクなどを作成し、見かけ上C:\Users を維持していると思います。
ところが、上記方法でWindowsを問題なく使用できていても、Google日本語をインストールした場合、メモ帳や主要なアプリで、日本語モードで入力中の文字がエコーバックされないなどの不具合が生じます。
icacls で ACL をリセットすると直ると思います。下記は一例です。
AppData\LocalLow\Google\Google Japanese Input へ移動し
♯ icacls * /reset /T /C /L
ずっと悩んでいたのですが、私はこれで治りました。